EvolvePro 설치¶

서버에 EvolvePro를 설치하고 두 개의 conda 환경을 생성합니다.

1. 코드 다운로드¶

cd /workspace/$USER/
git clone https://github.com/mat10d/EvolvePro.git
cd EvolvePro

EvolvePro 코어 라이브러리를 위한 환경입니다:

conda env create -f environment.yml
conda activate evolvepro

단백질 언어 모델(PLM) 임베딩 추출을 위한 별도 환경입니다:

sh setup_plm.sh
conda activate plm

왜 환경을 두 개 만드나요?

PyTorch 등 딥러닝 라이브러리와 EVOLVEpro 코어 라이브러리의 의존성이 충돌할 수 있습니다. 환경을 분리하여 이 문제를 방지합니다.

conda activate evolvepro
python -c "import evolvepro; print('evolvepro OK')"

conda activate plm
python -c "import torch; print(f'PyTorch OK, CUDA: {torch.cuda.is_available()}')"
python -c "import esm; print('ESM OK')"

evolvepro OK
PyTorch OK, CUDA: True
ESM OK

CUDA: False가 나오는 경우

GPU 드라이버 문제입니다. nvidia-smi를 실행하여 GPU가 정상인지 확인하고, 관리자에게 문의하세요.